Я могу переключиться на доменного пользователя командой su из-под root, но не под обычным пользователем, SSH тоже не работает

Если есть сложность с переключением на другого пользователя командой su из-под root, это обычно означает, что полностью обходится аутентификация SSSD, используя модуль pam_rootok.so. Вероятно, неверно настроена служба SSSD. Необходимо войти в систему как локальный пользователь и продолжить отладку под этим профилем.